Laboratorijoje, priklausomai nuo pašarų ir pašarinių žaliavų specifikos, atliekama specifinė mikrobiologinė analizė:
Patogeniniai veiksniai ( Salmonella, Listeria monocytogenes, E. coli, išmatų streptokokai)
Mielių ir pelėsių
nustatymasNTG, koliforminių bakterijų, enterobakterijų ir kt. nustatymas.