Laboratórium vykonáva v závislosti od špecifík potravinových výrobkov a potravinových doplnkov špecifickú mikrobiologickú analýzu:
Patogénne determinanty ( Salmonella, Listeria monocytogenes, E. coli, Fekálne streptokoky)
Stanovenie kvasiniek a plesní
Stanovenie NTG, koliformných baktérií, enterobaktérií atď.